Если вы хотите измерять точное эффективное значения импульсного тока, то частота отсчётов должна быть такой, чтобы в каждый импульс их попадало достаточно много (например, 10). Причём чем их больше, тем менее нужна синхронизация.
Если же Вы хотите измерять эффективное значение огибающей этих импульсов, то достаточно одного отсчёта на импульс, но отсчёты должны быть жёстко синхронизированы с импульсами и всегда попадать в одно и то же место каждого из них. При этом Вам придётся ещё определить (вычислить или измерить) поправочный коэффициент, на который нужно будет умножать результат измерения. Этот коэффициент будет разным в зависимости от конкретной формы импульсов и места, куда попадают отсчёты.